Le bureau dirige le syndicat, en application de l’article 12 des statuts. Il est composé, outre son président, de quatorze membres titulaires élus pour deux ans au scrutin majoritaire uninominal à un tour par le congrès. Le bureau attribue, par élection en son sein, des fonctions exécutives à ses membres, en particulier deux postes de vice-président.
Le bureau en fonction, élu le 25 novembre 2022 au congrès de Paris, est composé de la façon suivante :
| Président | Pierre GENÈVE |
| Vice-présidente | Laurence CHENKIER |
| Vice-président | Sébastien CECCHI |
| Secrétaire général | Louis-Damien FRUCHAUD |
| Secrétaire générale adjointe | Audrey CAVAILLIER |
| Trésorier | Philippe JAMIN |
| Trésorier adjoint | Pierre BERTHET |
| Membre | Isabelle FRANCOIS |
| Membre | Héloïse VADON |
| Membre | Caroline DUPUIS-VERBEKE |
| Membre | PLéa LHIOUI-PERRIN |
| Membre | Arnaud PIERRAT |
| Membre | Alexandre ABOU |
| Membre | Laurent CATINAUD |
| Membre | Matthieu LY VAN LUONG |
Le SJF dispose également d’un réviseur aux comptes, dont la fonction est actuellement assurée par Axelle TOUPET.
En vertu des articles 25 et 26 des statuts, le conseil national peut être réuni ; celui-ci comprend les membres du bureau et les délégués de section. Le conseil national est réuni pour prendre position sur des sujets d’importance stratégique qui requièrent une large approbation.